Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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