Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTCH1Q13635 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTCH1Q13635 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTCH1Q13635 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.5 ms