Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BFSP2Q13515 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BFSP2Q13515 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.9 ms