Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXE3Q13461 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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FOXE3Q13461 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FOXE3Q13461 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FOXE3Q13461 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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