Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LSAMPQ13449 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LSAMPQ13449 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
LSAMPQ13449 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LSAMPQ13449 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LSAMPQ13449 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LSAMPQ13449 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
LSAMPQ13449 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LSAMPQ13449 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LSAMPQ13449 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LSAMPQ13449 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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