Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNTA1Q13424 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNTA1Q13424 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SNTA1Q13424 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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