Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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TRAF3Q13114 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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TRAF3Q13114 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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TRAF3Q13114 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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TRAF3Q13114 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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