Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF3Q13114 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF3Q13114 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRAF3Q13114 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 307.4 ms