Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MKRN3Q13064 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MKRN3Q13064 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MKRN3Q13064 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
MKRN3Q13064 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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