Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GRIK3Q13003 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GRIK3Q13003 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIK3Q13003 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248.6 ms