Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAF2Q12933 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAF2Q12933 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAF2Q12933 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAF2Q12933 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAF2Q12933 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAF2Q12933 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAF2Q12933 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAF2Q12933 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF2Q12933 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRAF2Q12933 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAF2Q12933 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAF2Q12933 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRAF2Q12933 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.3 ms