Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
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