Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms