Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRAP18433 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRAP18433 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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PTPRAP18433 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRAP18433 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRAP18433 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRAP18433 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRAP18433 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRAP18433 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRAP18433 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRAP18433 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRAP18433 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRAP18433 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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