Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CLDN9O95484 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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CLDN9O95484 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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CLDN9O95484 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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CLDN9O95484 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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CLDN9O95484 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CLDN9O95484 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
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CLDN9O95484 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
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CLDN9O95484 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
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CLDN9O95484 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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CLDN9O95484 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CLDN9O95484 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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