Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP4O75379 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAMP4O75379 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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VAMP4O75379 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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VAMP4O75379 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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VAMP4O75379 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP4O75379 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP4O75379 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP4O75379 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP4O75379 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP4O75379 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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VAMP4O75379 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP4O75379 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP4O75379 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP4O75379 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP4O75379 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP4O75379 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP4O75379 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP4O75379 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP4O75379 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP4O75379 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP4O75379 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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