Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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SNX13Q9Y5W8 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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SNX13Q9Y5W8 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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SNX13Q9Y5W8 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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SNX13Q9Y5W8 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX13Q9Y5W8 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX13Q9Y5W8 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX13Q9Y5W8 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX13Q9Y5W8 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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SNX13Q9Y5W8 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX13Q9Y5W8 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
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SNX13Q9Y5W8 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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