Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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CLDN16Q9Y5I7 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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CLDN16Q9Y5I7 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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CLDN16Q9Y5I7 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN16Q9Y5I7 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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CLDN16Q9Y5I7 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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CLDN16Q9Y5I7 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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CLDN16Q9Y5I7 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN16Q9Y5I7 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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