Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.5 ms