Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.1 ms