Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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