Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.7 ms