Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC74AQ96AQ1 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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