Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FXNQ16595 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FXNQ16595 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FXNQ16595 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FXNQ16595 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FXNQ16595 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
FXNQ16595 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FXNQ16595 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FXNQ16595 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FXNQ16595 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FXNQ16595 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FXNQ16595 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FXNQ16595 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FXNQ16595 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FXNQ16595 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FXNQ16595 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FXNQ16595 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FXNQ16595 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FXNQ16595 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FXNQ16595 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FXNQ16595 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FXNQ16595 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FXNQ16595 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FXNQ16595 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FXNQ16595 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FXNQ16595 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FXNQ16595 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FXNQ16595 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FXNQ16595 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FXNQ16595 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FXNQ16595 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FXNQ16595 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FXNQ16595 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FXNQ16595 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FXNQ16595 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FXNQ16595 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FXNQ16595 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FXNQ16595 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FXNQ16595 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FXNQ16595 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FXNQ16595 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
FXNQ16595 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FXNQ16595 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FXNQ16595 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FXNQ16595 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FXNQ16595 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FXNQ16595 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FXNQ16595 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FXNQ16595 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FXNQ16595 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FXNQ16595 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FXNQ16595 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FXNQ16595 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FXNQ16595 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FXNQ16595 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FXNQ16595 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FXNQ16595 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FXNQ16595 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FXNQ16595 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FXNQ16595 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FXNQ16595 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FXNQ16595 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FXNQ16595 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FXNQ16595 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FXNQ16595 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FXNQ16595 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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FXNQ16595 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FXNQ16595 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FXNQ16595 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FXNQ16595 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FXNQ16595 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
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FXNQ16595 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FXNQ16595 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FXNQ16595 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FXNQ16595 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FXNQ16595 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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FXNQ16595 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FXNQ16595 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FXNQ16595 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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FXNQ16595 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FXNQ16595 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FXNQ16595 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FXNQ16595 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FXNQ16595 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FXNQ16595 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
FXNQ16595 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FXNQ16595 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FXNQ16595 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FXNQ16595 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FXNQ16595 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FXNQ16595 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FXNQ16595 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FXNQ16595 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
FXNQ16595 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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