Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC2□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
E2F4Q16254 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
E2F4Q16254 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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E2F4Q16254 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
E2F4Q16254 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
E2F4Q16254 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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