Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC6Q16204 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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CCDC6Q16204 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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CCDC6Q16204 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC6Q16204 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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CCDC6Q16204 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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CCDC6Q16204 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC6Q16204 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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