Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
USF2Q15853 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
USF2Q15853 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
USF2Q15853 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
USF2Q15853 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
USF2Q15853 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
USF2Q15853 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
USF2Q15853 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
USF2Q15853 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
USF2Q15853 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
USF2Q15853 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
USF2Q15853 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
USF2Q15853 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
USF2Q15853 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
USF2Q15853 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
USF2Q15853 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
USF2Q15853 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
USF2Q15853 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
USF2Q15853 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
USF2Q15853 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
USF2Q15853 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
USF2Q15853 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
USF2Q15853 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
USF2Q15853 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
USF2Q15853 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
USF2Q15853 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
USF2Q15853 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
USF2Q15853 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
USF2Q15853 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
USF2Q15853 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
USF2Q15853 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
USF2Q15853 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
USF2Q15853 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
USF2Q15853 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
USF2Q15853 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
USF2Q15853 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
USF2Q15853 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
USF2Q15853 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
USF2Q15853 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
USF2Q15853 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
USF2Q15853 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
USF2Q15853 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
USF2Q15853 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
USF2Q15853 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
USF2Q15853 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
USF2Q15853 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
USF2Q15853 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
USF2Q15853 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
USF2Q15853 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
USF2Q15853 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
USF2Q15853 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
USF2Q15853 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
USF2Q15853 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
USF2Q15853 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
USF2Q15853 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
USF2Q15853 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
USF2Q15853 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
USF2Q15853 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
USF2Q15853 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
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