Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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