Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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COL9A3Q14050 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A3Q14050 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
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