Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CDK13Q14004 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CDK13Q14004 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CDK13Q14004 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CDK13Q14004 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CDK13Q14004 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CDK13Q14004 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
CDK13Q14004 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.94□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CDK13Q14004 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.7 ms