Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GTF2H3Q13889 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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GTF2H3Q13889 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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GTF2H3Q13889 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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GTF2H3Q13889 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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GTF2H3Q13889 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GTF2H3Q13889 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GTF2H3Q13889 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
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