Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCOA4Q13772 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCOA4Q13772 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCOA4Q13772 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCOA4Q13772 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCOA4Q13772 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NCOA4Q13772 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCOA4Q13772 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCOA4Q13772 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCOA4Q13772 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NCOA4Q13772 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCOA4Q13772 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.5 ms