Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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TCIRG1Q13488 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
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TCIRG1Q13488 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCIRG1Q13488 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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