Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
FOXE3Q13461 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXE3Q13461 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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