Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
TUSC3Q13454 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUSC3Q13454 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms