Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-2.42□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TCOF1Q13428 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-2.48□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
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