Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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BNIP1Q12981 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
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BNIP1Q12981 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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BNIP1Q12981 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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