Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.1 ms