Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-3.02□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.04□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-3.04□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
CPSF1Q10570 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-3.1□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CPSF1Q10570 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
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