Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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HOXA4Q00056 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXA4Q00056 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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HOXA4Q00056 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
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HOXA4Q00056 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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HOXA4Q00056 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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