Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
CENPFP49454 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
CENPFP49454 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
CENPFP49454 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-4.51□□□□□ -3.13
CENPFP49454 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
CENPFP49454 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
CENPFP49454 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-4.52□□□□□ -3.13
CENPFP49454 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
CENPFP49454 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
CENPFP49454 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
CENPFP49454 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
CENPFP49454 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
CENPFP49454 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
CENPFP49454 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CENPFP49454 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CENPFP49454 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CENPFP49454 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CENPFP49454 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
CENPFP49454 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-4.56□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
CENPFP49454 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
CENPFP49454 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
CENPFP49454 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CENPFP49454 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
CENPFP49454 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
CENPFP49454 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
CENPFP49454 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CENPFP49454 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CENPFP49454 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-4.61□□□□□ -3.15
CENPFP49454 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CENPFP49454 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
CENPFP49454 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-4.62□□□□□ -3.15
CENPFP49454 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CENPFP49454 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CENPFP49454 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CENPFP49454 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CENPFP49454 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-4.64□□□□□ -3.15
CENPFP49454 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
CENPFP49454 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
CENPFP49454 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
CENPFP49454 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
CENPFP49454 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
CENPFP49454 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
CENPFP49454 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
CENPFP49454 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
CENPFP49454 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
CENPFP49454 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.15
CENPFP49454 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
CENPFP49454 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
CENPFP49454 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
CENPFP49454 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
CENPFP49454 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
CENPFP49454 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-4.67□□□□□ -3.16
CENPFP49454 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
CENPFP49454 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
CENPFP49454 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
CENPFP49454 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
CENPFP49454 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
CENPFP49454 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
CENPFP49454 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
CENPFP49454 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
CENPFP49454 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
CENPFP49454 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
CENPFP49454 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
CENPFP49454 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
CENPFP49454 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
CENPFP49454 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
CENPFP49454 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.16
CENPFP49454 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.17
CENPFP49454 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.17
CENPFP49454 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
CENPFP49454 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
CENPFP49454 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
CENPFP49454 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
CENPFP49454 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
CENPFP49454 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
CENPFP49454 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
CENPFP49454 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
CENPFP49454 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
CENPFP49454 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
CENPFP49454 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
CENPFP49454 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.6 ms