Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRXP46100 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRXP46100 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRXP46100 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRXP46100 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRXP46100 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRXP46100 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRXP46100 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRXP46100 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRXP46100 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRXP46100 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATRXP46100 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATRXP46100 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATRXP46100 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATRXP46100 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRXP46100 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRXP46100 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.6 ms