Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PITX3O75364 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PITX3O75364 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PITX3O75364 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PITX3O75364 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PITX3O75364 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PITX3O75364 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PITX3O75364 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PITX3O75364 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PITX3O75364 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PITX3O75364 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PITX3O75364 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-2.52□□□□□ -2.81
PITX3O75364 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PITX3O75364 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PITX3O75364 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PITX3O75364 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PITX3O75364 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PITX3O75364 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PITX3O75364 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PITX3O75364 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PITX3O75364 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PITX3O75364 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PITX3O75364 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PITX3O75364 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PITX3O75364 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.55□□□□□ -2.82
PITX3O75364 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PITX3O75364 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PITX3O75364 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PITX3O75364 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-2.56□□□□□ -2.82
PITX3O75364 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PITX3O75364 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PITX3O75364 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PITX3O75364 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PITX3O75364 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PITX3O75364 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.56□□□□□ -2.82
PITX3O75364 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PITX3O75364 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PITX3O75364 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PITX3O75364 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PITX3O75364 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PITX3O75364 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PITX3O75364 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PITX3O75364 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PITX3O75364 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PITX3O75364 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PITX3O75364 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PITX3O75364 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PITX3O75364 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PITX3O75364 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.3 ms