Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERVV-2B6SEH9 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.1 ms