Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LYVE1Q9Y5Y7 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LYVE1Q9Y5Y7 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LYVE1Q9Y5Y7 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LYVE1Q9Y5Y7 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LYVE1Q9Y5Y7 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LYVE1Q9Y5Y7 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
LYVE1Q9Y5Y7 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LYVE1Q9Y5Y7 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.2 ms