Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
USP18Q9UMW8 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP18Q9UMW8 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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USP18Q9UMW8 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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USP18Q9UMW8 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USP18Q9UMW8 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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