Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.62□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-2.64□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-2.64□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.71□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-2.73□□□□□ -2.85
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