Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS3Q99687 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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MEIS3Q99687 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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MEIS3Q99687 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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MEIS3Q99687 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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MEIS3Q99687 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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MEIS3Q99687 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS3Q99687 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MEIS3Q99687 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MEIS3Q99687 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MEIS3Q99687 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MEIS3Q99687 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MEIS3Q99687 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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