Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-2.6□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-2.68□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CCDC115Q96NT0 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.7 ms