Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q6P435 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q6P435 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Q6P435 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q6P435 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q6P435 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q6P435 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Q6P435 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Q6P435 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Q6P435 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Q6P435 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Q6P435 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Q6P435 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Q6P435 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q6P435 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q6P435 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q6P435 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q6P435 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q6P435 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q6P435 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q6P435 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q6P435 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q6P435 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q6P435 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q6P435 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q6P435 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q6P435 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q6P435 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q6P435 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q6P435 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q6P435 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Q6P435 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Q6P435 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Q6P435 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Q6P435 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Q6P435 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Q6P435 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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