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Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2
H3F3C, Histone H3.3C, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
H3F3C
Q6NXT2
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BASIC
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□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
MTCYBP9-201
ENST00000431021
303 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
AL118496.2-201
ENST00000448300
230 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
MIR6086-201
ENST00000638065
55 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-957P-201
ENST00000363652
99 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
MT-TY-201
ENST00000387409
66 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-284P-201
ENST00000411105
106 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
IGKV1-22-201
ENST00000524313
326 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
MIR3163-201
ENST00000581592
73 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
Evf-2_5p.1-201
ENST00000614213
142 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
SNORD36A-201
ENST00000362874
73 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.207-201
ENST00000364142
106 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
RNU4-11P-201
ENST00000365287
132 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.552-201
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112 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-460P-201
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108 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
MIR1263-201
ENST00000408324
86 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
RNU6ATAC41P-201
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126 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.596-201
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109 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-1023P-201
ENST00000516137
106 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.247-201
ENST00000364500
92 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.307-201
ENST00000365022
117 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
MIR652-201
ENST00000385278
98 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
RNU7-121P-201
ENST00000516604
62 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.692-201
ENST00000516627
105 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
RNA5SP66-201
ENST00000517178
101 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
AC130289.1-201
ENST00000577321
73 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
AC141273.2-201
ENST00000618989
130 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.173-201
ENST00000363776
113 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-1318P-201
ENST00000365389
103 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
MIR759-201
ENST00000390224
91 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-735P-201
ENST00000410612
107 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
MIR4432-201
ENST00000581823
84 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
AC108676.2-201
ENST00000605225
163 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
MIR20A-201
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71 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
SNORD115-19-201
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BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
SNORD115-18-201
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82 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.133-201
ENST00000363428
110 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
SNORD95.1-201
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BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
SNORD115-17-201
ENST00000364612
82 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-901P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-762P-201
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102 nt
BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
RNU6-90P-201
ENST00000606352
106 nt
BASIC
-0.67
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H3F3C
Q6NXT2
RNU6-1244P-201
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
RNU6-915P-201
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BASIC
-0.68
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H3F3C
Q6NXT2
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BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-327P-201
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BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
RNA5SP169-201
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
MIR3121-201
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
FTX_2.1-201
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.78-201
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
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H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.213-201
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BASIC
-0.69
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H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.297-201
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BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-574P-201
ENST00000384265
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
MIR9-2-201
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.644-201
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.674-201
ENST00000516362
113 nt
BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
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ENST00000517162
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
U4.1-201
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
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H3F3C
Q6NXT2
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
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H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.155-201
ENST00000363632
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H3F3C
Q6NXT2
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
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110 nt
BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
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131 nt
BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
RPS29P8-201
ENST00000445109
171 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
HAR1A.1-201
ENST00000459583
118 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-861P-201
ENST00000516745
106 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
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103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
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175 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
AC072026.1-201
ENST00000605023
201 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
MIR548AZ-201
ENST00000616567
95 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
uc_338.36-201
ENST00000622331
158 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
SNORD38.1-201
ENST00000363863
68 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.198-201
ENST00000364013
98 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-466P-201
ENST00000391224
103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
snoU13.11-201
ENST00000459219
104 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-1313P-201
ENST00000362622
102 nt
BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
RNU6-1062P-201
ENST00000383908
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
H3F3C
Q6NXT2
RNU6-1184P-201
ENST00000384588
108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
H3F3C
Q6NXT2
SNORD56B-201
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71 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
H3F3C
Q6NXT2
MIR548D2-201
ENST00000384955
97 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
H3F3C
Q6NXT2
AC244090.1-201
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93 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
H3F3C
Q6NXT2
snoU13.13-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
H3F3C
Q6NXT2
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126 nt
BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
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BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
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107 nt
BASIC
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H3F3C
Q6NXT2
SNORD114-15-201
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BASIC
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□□□□□ -2.53
H3F3C
Q6NXT2
Y_RNA.272-201
ENST00000364696
102 nt
BASIC
-0.74
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H3F3C
Q6NXT2
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ENST00000384114
104 nt
BASIC
-0.74
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H3F3C
Q6NXT2
MIR224-201
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81 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
H3F3C
Q6NXT2
AL353813.1-201
ENST00000440700
253 nt
BASIC
-0.74
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H3F3C
Q6NXT2
RNU7-197P-201
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62 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
H3F3C
Q6NXT2
COX7A2-206
ENST00000472311
325 nt
TSL 2
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
H3F3C
Q6NXT2
SNORD38.3-201
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73 nt
BASIC
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Q6NXT2
RNU6-1234P-201
ENST00000516877
103 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
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