Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMEM200BQ69YZ2 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMEM200BQ69YZ2 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMEM200BQ69YZ2 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TMEM200BQ69YZ2 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TMEM200BQ69YZ2 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TMEM200BQ69YZ2 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TMEM200BQ69YZ2 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TMEM200BQ69YZ2 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TMEM200BQ69YZ2 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TMEM200BQ69YZ2 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms